укр. рус.
Словник
Всі АБВГДЕЄЖЗИІЇКЛМНОПРСТУФХЦЧШЩЮЯ  
All ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ  

Секвенування ДНК
Sequencing
Секвенування ДНК

Секвенування ДНК (від англ. "Sequence" - послідовність) - визначення послідовності нуклеотидів у ланцюгу ДНК. Використовується для розшифровки генів і занесення цієї інформації до банку даних та її подальшої інтерпретації методами біоінформатикДля секвенування ДНК застосовуються методи Едмана, Сенгера та інші; у даний час для секвенування нуклеїнових кислот застосовується метод Сенгера з дидезоксинуклеозидтрифосфатами (ddNTP).

Згідно методикам до початку секвенування з використанням полімеразної ланцюгової реакції (ПЛР) виконують ампліфікацію (збільшення числа копій) досліджуваної ділянки ДНК, послідовність якої потрібно визначити. Крім ампліфікації ДНК, ПЛР дозволяє проводити безліч інших маніпуляцій з нуклеїновими кислотами: введення мутацій, зрощення фрагментів ДНК тощо. Метод широко використовується в біологічній і медичній практиці, наприклад, для діагностики спадкових захворювань, встановлення батьківства, клонування генів, виділення нових генів.

Історія секвенування ДНК. Уперше геном був розшифрований у найпримітивніших живих істот - вірусів. Першими розшифровані ДНК вірусу натуральної віспи (1993), геном цитомегаловірусу, геном вірусу осповакцини, а також геноми органоидов клітин еукаріотів - мітохондріальний геном і хлоропластной моху, хлоропласний геном евглени Euglena polymorpha.

Перший геном самостійного живого організму, який вдалося секвенувати, належить бактерії Haemophilus influenzae (1995). У виконанні проекту взяло участь 40 науковців з 4 дослідницьких центрів США. Далі пішла серія аналогічних робіт, наприклад, над геномами Mycoplasma genitalum (1995), архебактерії Methanococcus jannaschii (1996), бактерії Methanobacterium thermoautotrophicum, кишкової палички Escherichia coli (1997) та багато інших. Перераховані бактерії - прокаріоти (у них немає оформленого ядра), їх геном, як правило, представлений тільки кільцевою молекулою ДНК.

Наступний крок - розшифровка геномів еукаріотів. (Еукаріоти - організми, клітини яких мають чітко оформлене ядро, до них належать і люди).

У 1996 році завершено роботу над розшифровкою генома дріжджів Saccharomyces cerevisiae. Над цим проектом працювала ціла мережа дослідних центрів і лабораторій у США, Західній Європі та Японії. Було визначено 12 млн. 68 тпн* із 13389 тпн повного генома, розподіленого в 16-ти хромосомах.

Технологія піросеквенування (секвенування шляхом синтезу) використовується в даний час компанією Roche Diagnostics і дозволяє визначати близько 400 мільйонів нуклеотидів за 10-годинний період роботи на одній установці. Кожен раунд роботи коштує близько п`яти-семи тисяч доларів.

*тисяч пар нуклеотидів

повернутися до списку
visa MasterCard оплата готівкою мобільна версія Facebook Genex.Ukraine linkedIn  YouTube GenexUkraine